几种常见的容易与孤独症混淆的症状，包括：选择性缄默症、语言障碍与社交(语用)交流障碍、智力发育障碍、刻板运动障碍、注意缺陷/多动障碍、精神分裂症。

1.选择性缄默症

在选择性缄默症中，早期发育通常没有被干扰。儿童通常能在一些背景和环境下表现出恰当的交流技能。即使在儿童缄默的场所，社交的交互性也未受损，也没有受限的或重复的行为模式。

2.语言障碍与社交(语用)交流障碍

在一些形式的语言障碍中，可能存在交流问题和一些继发的社交困难。然而，特定的语言障碍通常与异常的非言语交流无关，也没有受限的、重复的行为、兴趣或活动模式。

当个体显示出社交交流和社交互动的损害但未显示出受限的和重复的行为或兴趣时，可能符合社交(语用)交流障碍的诊断标准，而不是孤独症谱系障碍。当符合孤独症谱系障碍的诊断标准时，孤独症谱系障碍的诊断可以取代社交(语用)交流障碍的诊断，同时关于既往或目前的受限/重复的行为模式应该仔细询问。

3.不伴有孤独症谱系障碍的智力障碍(智力发育障碍)

在非常年幼的儿童中，鉴别出孤独症谱系障碍和不伴有孤独症谱系障碍的智力障碍是困难的。如果有智力障碍的个体没有发展出语言或符号语言的技能，就对鉴别诊断提出了挑战，因为重复的行为经常出现在这样的个体中。在有智力障碍的个体中当社交交流和互动相对于个体非言语技能(如精细运动能力、非言语问题的解决能力)的发育水平显著受损时，诊断孤独症谱系障碍是恰当的。作为对比，当社交交流技能和其他智力技能的水平没有显著差异时，诊断智力障得更为恰当。

4.刻板运动障碍

运动的刻板性是孤独症谱系障碍的诊断特征之一，当这样的重复行为可以更好地用孤独症谱系障碍解释时，不需要再额外给予刻板运动障碍的诊断。然而，当刻板动作引起自我伤害和成为治疗焦点时，可以给予两种诊断。

5.注意缺陷/多动障得

注意的异常(过度关注或容易分神)、多动症状常见于有孤独症谱系障得的个体中。当注意困难或多动超出了和心智年龄相匹配的个体的常见状况时，应考虑注意缺陷或多动障碍的诊断。

6.精神分裂症

儿童期起发病的精神分裂症通常在一个正常或接近正常的发育阶段后出现。前驱期状态是指社交损害、非典型兴趣和信念，这些症状会与孤独症谱系障碍中的社交缺陷混淆。作为精神分裂症特征的幻觉和妄想不是孤独症谱系障碍的特征。然而，临床工作者在分析孤独症谱系障碍个体的精神分裂症关键特征的相关问题时，要考虑到潜在的具体化倾向。如：“你在没人的时候能听见声音吗?”“能”他可能是想表达在收音机里听见声音。

7.共病问题

孤独症谱系障碍常与智力损害和结构性语言障碍有关(即不能使用恰当的语法理解和构建句子)，当适用时应该备注相应的标注。许多孤独症谱系障碍个体存在不构成该障碍诊断标准的精神疾病症状(约70%有孤独症谱系障得的个体可能有一种共病的精神障碍，40%可能有两种或多种共病的精神障碍)。当同时满足注意缺陷/多动障碍和孤独症谱系障碍的诊断标准时，应给予两种诊断。该原则适用于同时存在的孤独症谱系障碍和发育性协调障碍、焦虑障碍、抑郁障碍的诊断及其他共病的诊断。在那些不能讲话或有语言缺陷的个体中，如果观察到如睡眠或进食的改变和挑衅性行为增加的迹象，则提示应进行焦虑或抑郁的评估。与发育性协调障碍一样，特定的学习困难(识字和识数)很常见。与孤独症谱系障碍有关的常见的躯体疾病，是通过遗传或环境影响而获得的。这些躯体疾病包括癫痫、睡眠问题和便秘。回避性或限制性摄食障碍是孤独症谱系障碍常见的特征，并可能持续存在极端和有限的食物偏好。

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